Νέα τεχνολογία «θα διαβάζει το ανθρώπινο γονιδίωμα σε 15 λεπτά»
Ημερομηνία:
20/2/2012, 01:28 - Εμφανίσεις: 123
Î’Ïετανική εταιÏεία παÏουσίασε Îνα νÎο σÏστημα για τον Ï€ÏοσδιοÏισμό της αλληλουχίας του DNA το οποίο, όπως υποστηÏίζει, θα μποÏεί να διαβάζει Îνα ολόκληÏο ανθÏώπινο γονιδίωμα σε διάστημα 15 λεπτών. Την τελευταία δεκαετία, οι τεχνολογίες Ï€ÏοσδιοÏÎ¹ÏƒÎ¼Î¿Ï Ï„Î·Ï‚ γενετικής αλληλουχίας Îχουν βελτιωθεί εντυπωσιακά: το διεθνÎÏ‚ Î ÏόγÏαμμα ΑνθÏώπινου Γονιδιώματος χÏειάστηκε δÎκα χÏόνια και αÏκετά δισεκατομμÏÏια δολάÏια για να παÏάξει την Ï€Ïώτη πλήÏη ανθÏώπινη αλληλουχία, κάτι που μποÏεί σήμεÏα να γίνει σε λίγες εβδομάδες και με κόστος μεÏικών χιλιάδων δολαÏίων.
Το μηχάνημα που παÏουσίασε η Oxford Nanopore Technologies, με ÎδÏα την ΟξφόÏδη της Î’Ïετανίας, αξιοποιεί Ï€Ïακτικά την ιδÎα της «αλληλοÏχισης νανοπόÏου», μιας ιδÎας που είχε Ï€Ïωτοδιατυπωθεί στις αÏχÎÏ‚ της δεκαετίας του 1990. Στην τεχνική αυτή, το μόÏιο του DNA αναγκάζεται να πεÏάσουν από Îναν μικÏοσκοπικό πόÏο, ή «νανοπόÏο», και οι βάσεις από τις οποίες αποτελείται (A, T, C, G) αναγνωÏίζονται μία-μία από τις διαφοÏÎÏ‚ που παÏουσιάζουν στην ηλεκτÏική τους αγωγιμότητα.
Το δεÏτεÏο εξάμηνο του 2012, η Oxford σχεδιάζει να λανσάÏει το Ï€Ïώτο της σÏστημα «GridION», το οποίο θα πεÏιλαμβάνει 2.000 νανοπόÏους, οι οποίες θα διαβάζουν την αλληλουχία του DNA με Ïυθμό μεÏικών εκατοντάδων χιλιάδων βάσεων ανά δευτεÏόλεπτο. Το 2013 θα ακολουθήσει Îνα σÏστημα των 8.000 νανοπόÏων. Είκοσι Ï„Îτοια μηχανήματα σε παÏάλληλη λειτουÏγία θα μποÏοÏν να διαβάσουν τις Ï„Ïεις δισεκατομμÏÏια βάσεις του ανθÏώπινου γονιδιώματος σε 15 πεÏίπου λεπτά, με κόστος λίγων χιλιάδων δολαÏίων.
ΕπιπλÎον, το νÎο sequencer αφήνει άθικτα τα μόÏια DNA που εξετάζει, αντί να τα καταστÏÎφει όπως οι σημεÏινÎÏ‚ τεχνολογίες, και επιπλÎον μποÏεί να διαβάζει μεγαλÏτεÏα μόÏια, μήκος 100.000 βάσεων.
ΣÏμφωνα με την εταιÏεία, η τεχνολογία στη σημεÏινή της μοÏφή διαβάζει λανθασμÎνα το 4% των βάσεων και επομÎνως η αλληλοÏχιση του DNA με επαÏκή ακÏίβεια απαιτεί πολλαπλά πεÏάσματα, όπως συμβαίνει και με τα σημεÏινά sequencer. To ποσοστό λαθών, όμως, θα μποÏοÏσε να Ï€Îσει στο 0,1 με 1 τοις εκατό μÎχÏι τα Ï„Îλη του Îτους, σÏμφωνα τουλάχιστον με την Oxford.
Όπως αναφÎÏει το Nature.com, την πεÏασμÎνη εβδομάδα η Oxford παÏουσίασε στην επιστημονική κοινότητα την Ï€Ïώτη αλληλουχία που Ï€ÏοσδιοÏίστηκε με το νÎο σÏστημα, ολόκληÏο το γονιδίωμα ενός Î¹Î¿Ï Ï€Î¿Ï… ονομάζεται φάγος Phi X. Πολλοί εÏευνητÎÏ‚ πεÏιμÎνουν τώÏα να διαπιστώσουν αν τα αποτελÎσματα θα είναι εξίσου εντυπωσιακά και στην πεÏίπτωση του μεγαλÏτεÏου και πιο πεÏίπλοκου ανθÏώπινου γονιδιώματος.
Το μÎλλον θα δείξει αν η Oxford Nanopore Technologies θα καταφÎÏει να γίνει μεγάλος παίκτης στη βιομηχανία sequencing, που απολαμβάνει πλÎον ταχÏτατη ανάπτυξη: τον πεÏασμÎνο μήνα, ο γίγαντας της φαÏμακοβιομηχανίας Roche Ï…Ï€Îβαλε Ï€Ïόταση για την εξαγοÏά της αμεÏικανικής Illumina, η οποία είναι σήμεÏα ο μεγαλÏτεÏος κατασκευαστής sequencer.
Τον ίδιο μήνα, η νεοσÏστατη Ion Torrent Systems, με ÎδÏα στο ΚονÎκτικατ, ανακοίνωσε ότι ετοιμάζεται να λανσάÏει Îνα μηχάνημα που διαβάζει ολόκληÏο το ανθÏώπινο γονιδίωμα σε μία μÎÏα και με κόστος μικÏότεÏο από 1.000 δολάÏια. ΧάÏη στις εξελίξεις αυτÎÏ‚, η εποχή των Ï€Ïοσωπικών γονιδιωμάτων και της εξατομικευμÎνης ιατÏικής δείχνει να ÎÏχεται πιο κοντά...

Πηγή: in.gr
Πηγή: techteam.gr
Νέα τεχνολογία «θα διαβάζει το ανθρώπινο γονιδίωμα σε 15 λεπτά»
|
|
|